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百度開(kāi)放LinearFold算法 可提升新冠病毒RNA結(jié)構(gòu)檢測(cè)速度

 2020-02-01 09:21  來(lái)源: A5創(chuàng)業(yè)網(wǎng)   我來(lái)投稿 撤稿糾錯(cuò)

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A5創(chuàng)業(yè)網(wǎng)(公眾號(hào):iadmin5)2月1日?qǐng)?bào)道,百度研究院宣布,將向各基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)、防疫中心及全世界科學(xué)研究中心免費(fèi)開(kāi)放線性時(shí)間算法 LinearFold 以及世界上現(xiàn)有最快的RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)網(wǎng)站,以提升新型冠狀病毒RNA空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)速度,從而助力疫情防控。

據(jù)悉,該算法使得整序列、整基因組的 RNA 結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)成為可能,也是RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)領(lǐng)域40年來(lái)第一次重大提速。這項(xiàng)工作發(fā)表于生物信息學(xué)頂級(jí)會(huì)議 ISMB 2019 和生物信息學(xué)權(quán)威雜志 Bioinformatics,受到了諸多業(yè)內(nèi)專家的高度評(píng)價(jià)。

值得一提的是,由于新型冠狀病毒已經(jīng)在多個(gè)國(guó)家出現(xiàn),百度開(kāi)放LinearFold網(wǎng)站給全世界科學(xué)家免費(fèi)使用,較同類(lèi)網(wǎng)站相比,在RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)速度和序列長(zhǎng)度方面,該網(wǎng)站都具有明顯優(yōu)勢(shì),在預(yù)測(cè)速度上無(wú)出其右,而且能處理的最長(zhǎng)序列長(zhǎng)度達(dá)10萬(wàn)堿基,能滿足對(duì)RNA病毒全基因組結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的要求。

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